Во время войны оказался в Омске. Там тренировал будущих летчиков, но на фронт так и не попал.
По окончании военного факультета института физкультуры молодой лейтенант Валерий Балюлис назначается начальником по физподготовке Омского авиационного училища. Ветеран вспоминает, как трудно было в голодные военные годы целыми днями бегать кроссы, работать с гирями и штангой, проводить 8-часовые занятия с курсантами по лыжной подготовке – довольствие летчиков-курсантов велось по летным нормам, а у преподавателей — по нормам служащих – 200 граммов хлеба в сутки, суп «со следами картошки» и запахом мяса, свекольный чай без сахара, а на таком довольствии много не побегаешь. Но никто не жаловался, все понимали, что их работа нужна для победы над врагом. Неоднократные рапорты об отправке в действующую армию успеха не имели – согласно Директиве Верховного Главнокомандующего преподаватели военных училищ не подлежали направлению на фронт.
Весной 1955 года Валерия Петровича переводят в Павлодарское военное училище летчиков, откуда после демобилизации в 1959 году он переезжает в Краснодар, где жила его мама. Работа преподавателем физкультуры в школе и пионерском лагере, на турбазе в поселке Абрау-Дюрсо, начальник по физподготовке Оренбургского музыкального училища, автоколонна № 1499 в Краснодаре – вот далеко не полный перечень должностей Валерия Петровича Балюлиса, Ветерана труда с более чем 20-летним гражданским и 22-х летним календарным воинским стажем, кавалера Ордена Красной Звезды и многих медалей, в том числе «За Боевые заслуги» и «За Победу над Германией».